2-氯-5-氟嘧啶（62802-42-0）可用作醫藥化工合成中間體。

2-氯-5-氟嘧啶可用作醫藥生物化工中間體，如用于制備2-羥基-5-氟嘧啶。 5-氟嘧啶衍生物是臨床上的一種抗瘤廣譜、效率較高的抗代謝藥物，它對多種腫瘤有抑制作用。

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